Six types d'agents pathogènes respiratoires

La maladie à coronavirus 2019, ou COVID-19, désigne la pneumonie causée par l'infection au SARS-CoV-2. Le SARS-CoV-2 est un coronavirus appartenant au genre β. La COVID-19 est une maladie infectieuse respiratoire aiguë, et la population y est généralement susceptible. Actuellement, la principale source d'infection est constituée par les patients infectés par le SARS-CoV-2, mais les personnes infectées asymptomatiques peuvent également transmettre le virus. Selon les enquêtes épidémiologiques actuelles, la période d'incubation est de 1 à 14 jours, le plus souvent de 3 à 7 jours. Les principaux symptômes sont la fièvre, la toux sèche et la fatigue. Quelques patients présentent également une congestion nasale, un écoulement nasal, des maux de gorge, des myalgies et de la diarrhée.

La grippe, ou influenza, est une maladie infectieuse respiratoire aiguë causée par le virus de la grippe. Très contagieuse, elle se transmet principalement par la toux et les éternuements. Elle survient généralement au printemps et en hiver. Les virus de la grippe se divisent en trois types : grippe A (H1N1), grippe B (H3N2) et grippe C (H3N2). Tous appartiennent à la famille des virus à ARN monocaténaire segmenté, responsables de maladies chez l'homme. Le virus de la grippe A, qui comprend les sous-types H1N1, H3N2 et autres, provoque une infection respiratoire aiguë et est sujet à des mutations et à des épidémies dans le monde entier. Le terme « shift » désigne la mutation du virus de la grippe A, entraînant l'émergence d'un nouveau sous-type viral. Les virus de la grippe B se divisent en deux lignées : Yamagata et Victoria. Le virus de la grippe B ne subit qu'une dérive antigénique et échappe à la surveillance et à l'élimination par le système immunitaire humain grâce à ses mutations. Cependant, le virus de la grippe B évolue plus lentement que le virus de la grippe A. Le virus de la grippe B peut également provoquer des infections respiratoires chez l'homme et entraîner des épidémies.

L'adénovirus (AdV) appartient au genre Adénovirus, un virus à ADN double brin dépourvu d'enveloppe. On dénombre au moins 90 génotypes, répartis en 7 sous-genres (AG 7). L'infection par l'AdV peut provoquer diverses maladies, notamment des pneumonies, des bronchites, des cystites, des conjonctivites, des gastro-entérites et des encéphalites. La pneumonie à adénovirus est l'une des formes les plus graves de pneumonie communautaire chez l'enfant, représentant environ 4 à 10 % des pneumonies communautaires.

Mycoplasma pneumoniae (MP) est un micro-organisme procaryote de très petite taille, situé entre les bactéries et les virus. Il possède une structure cellulaire mais est dépourvu de paroi cellulaire. MP est principalement responsable d'infections des voies respiratoires humaines, notamment chez les enfants et les jeunes. Il peut provoquer une pneumonie à mycoplasme, une infection des voies respiratoires de l'enfant et une pneumonie atypique. Les manifestations cliniques sont variées, les plus fréquentes étant une toux sévère, de la fièvre, des frissons, des maux de tête et des maux de gorge. Les infections des voies respiratoires supérieures et les pneumonies bronchiques sont les plus courantes. Chez certains patients, une infection des voies respiratoires supérieures peut évoluer vers une pneumonie sévère, une détresse respiratoire aiguë et, dans certains cas, le décès.

Le virus respiratoire syncytial (VRS) est un virus à ARN appartenant à la famille des Paramyxoviridae. Il se transmet par voie aérienne et par contact étroit et constitue le principal agent pathogène des infections des voies respiratoires inférieures chez le nourrisson. Les nourrissons infectés par le VRS peuvent développer une bronchiolite sévère et une pneumonie, souvent associées à l'asthme infantile. Les symptômes chez le nourrisson sont sévères : forte fièvre, rhinite, pharyngite et laryngite, puis bronchiolite et pneumonie. Dans certains cas, des complications telles qu'une otite moyenne, une pleurésie ou une myocardite peuvent survenir. Chez l'adulte et l'enfant plus âgé, l'infection se manifeste principalement par une infection des voies respiratoires supérieures.